更新于 2022/10/18
籍贯 | 湖北荆门 | 出生年月 | 1993年10月 | 政治面貌 | 中共党员 |
电子邮箱 | jingyunluo@foxmail.com | ||||
通讯地址 | 湖北省武汉市华中农业大学作物遗传改良全国重点实验室 |
教育背景
- 2020.12-至今:华中农业大学作物遗传改良全国重点实验室玉米团队严建兵教授课题组博士后,主要研究方向:多组学大数据分析,基因预测和分子育种,机器学习
- 2011.09-2020.12:华中农业大学生命科学技术学院本硕博连读,获理学博士学位,主要研究方向:群体遗传学和基因组学,GWAS 与 QTL 定位,生物信息分析
科研经历
本人博士期间主要从事玉米群体遗传学和大数据组学研究,基于玉米的大型人工合成群体 CUBIC 群体,利用单标记和单倍型全基因组关联分析对 23 个农艺性状 进行了基因定位并克隆了一个影响叶宽的基因(Liu et al 2020),同时开发了 CUBIC 群体的组学数据整合及分析数据库平台(Luo et al 2020,软件著作权:2019SR0156468); 与此同时参与了大量代谢组相关的分析和基因定位工作(Deng et al 2017, Deng et al 2020);还参与了玉米籽粒等重要性状相关功能基因克隆的部分工作(Liu et al 2015, Yang et al 2019), 以及杂种优势和基因组预测方便的工作(Xiao et al 2021, Yang et al 2020)。
目前,博士后期主要是两个方向的工作,一是结合新技术、大数据分析和新群体设计,解析玉米复杂性状的遗传基础和克隆关键基因;二是跟踪基因组学等生物 学研究动态,以统计和机器学习算法为纽带,推动理论研究成果应用于玉米育种。主要课题有:
- 主要研究课题是糯玉米鲜食风味的遗传结构和代谢基础的解析,通过将糯玉米群体和普通玉米群体的基因组、转录组以及代谢组数据的结合比较分析,探索糯玉米群体的起源和特有的进化历史,与普通玉米的差别。同时结合了代谢组转录组数据与一个百人品尝的实验,解析糯玉米的风味的独特的代谢和基因水平的分子遗传基础,为糯玉米的遗传改良和分子育种提供帮助。
- 主要参与负责了实验室 507 份玉米自交系关联群体和 184 份大刍草群体的大数据分析工作,包括 DNA-SEQ 基因组数据,RNA-SEQ 转录组数据的分析,群体水平上的选择进化分析和群体适应性分析,重要 QTL 和 eQTL 的定位分析,多组学的结合比较分析等工作。
- 主要负责多组学数据结合机器学习方法预测复杂产量性状的课题,利用现有的多种机器学习方法模型,基于 B73 和 BY804 的 RIL 群体的 167 份材料的表型组数据、以及一些辅助的基因型和 QTL 数据,对于群体的产量相关性状进行预测,提高对于群体产量表型的预测精度。
- 主要参与一个基因组选择和作物模型结合预测产量的合作课题,利用玉米 CUBIC 群体的 300 个有代表性杂交种,在多个环境下收集农艺性状,通过土壤和气象环境数据,建立不同基因型玉米的生长模型,结合全基因组基因型数据,解析生长模型重要参数的遗传机理,构建作物生长模型预测算法,预测玉米不同环境下的表型 (和美国 Auburn 大学合作)。
个人技能
- 实验技术
- 熟练掌握分子克隆、分子标记检测筛选等多种分子生物学实验技术
- 具有三年的田间种植和管理经验
- 数据分析
- 熟悉 Perl 和 R 语言以及 Linux 系统和 shell 脚本
- 熟悉基因组转录组代谢组等多组学的大数据分析工作
- 熟悉群体的突变重组和进化分析等相关生物信息分析
- 熟悉数量性状的基因定位,优良基因鉴定、特定性状遗传机理工作
- 熟悉常用的生物数据库网站及各种生物数据存储格式
- 英语能力
- 通过 CET4 (579分) 和 CET6 (520分),能较熟练地进行专业英文阅读及写作
- 其他技能
- 熟练运用微软 office 套件进行写作和展示
- PS、AI 等图像处理软件
荣誉奖励
- 2014-2015 雷奥奖学金
- 2015 第二届“菲沙杯”生物信息项目设计大赛冠军
- 2015-2016 校“三好研究生”
- 2015-2016 康农种业奖学金
- 2016 全国植物生物学大会墙报展三等奖
- 2022 第一届湖北省博士后创新创业大赛优胜奖
- 2021-2023 华中农业大学优秀博士后资助
大会报告
- 2017 武汉大学华中高校学术交流会三等奖
- 2017 湖北大学生命科学院第三届研究生学术论坛一等奖
- 2021年4月19-21日,第五届全国玉米生物学学术研讨会专题报告,一等奖
- 2021年11月11日,全国.深圳鲜食玉米学术研讨会暨第五届龙田文化玉米节,专家报告
- 2022年4月28日-4月30日,Plant Genomes Online,Selected talks
基金项目
- 国家自然科学基金委员会,青年科学基金项目,32101773,影响糯玉米鲜食风味基因 ZmBZR1 的功能研究,2022-01-01 至2 024-12-31,30 万元,主持
- 中国博士后科学基金第71批面上资助二等,资助编号:2022M711280,8 万元,主持
- 国家自然科学基金委员会,联合基金项目,U1901201,甜玉米品质遗传基础解析及关键基因挖掘和利用,2020-01-01 至 2023-12-31,262 万元,参与
已发表论文
详见 Publications。